بافر 10X Genetic Analyzer with EDTA برای دستگاه 3130 و 3130xl

بافر 10X Genetic Analyzer with EDTA چیست؟

10X Genetic Analyzer Buffer with EDTA یک محلول بافر غلیظ برای استفاده در سیستم‌های ژنتیک آنالایزر مبتنی بر Capillary Electrophoresis است. این بافر برای ایجاد Running Buffer موردنیاز هنگام انجام آزمایش‌های تعیین توالی DNA و Fragment Analysis استفاده می‌شود.

طبق مستند رسمی سازنده، Running Buffer 10X with EDTA یک ریجنت عمومی برای استفاده به‌عنوان محلول بافر در زمان الکتروفورز روی Genetic Analyzerهای مبتنی بر الکتروفورز موئینه است.

کاربرد Running Buffer 10X در ژنتیک آنالایزر 3130 و 3130xl

در راهنمای رسمی دستگاه‌های Applied Biosystems 3130 و 3130xl Genetic Analyzer به‌طور مشخص استفاده از 10X Genetic Analyzer Buffer with EDTA برای تهیه Running Buffer توصیه شده است.

Running Buffer در سیستم الکتروفورز موئینه نقش مهمی در ایجاد شرایط مناسب برای حرکت و جداسازی قطعات DNA در کاپیلاری‌ها دارد. کیفیت و غلظت صحیح بافر از عوامل مؤثر بر عملکرد مناسب دستگاه و دستیابی به نتایج پایدار در فرایند آنالیز محسوب می‌شود.

کاربرد Running Buffer 10X در DNA Sequencing و Fragment Analysis

این بافر برای جریان‌های کاری مبتنی بر DNA Sequencing و Fragment Analysis در دستگاه‌های Capillary Electrophoresis طراحی شده است. در ژنتیک آنالایزرهای سری 3130، این دو گروه از کاربردها از مهم‌ترین فرآیندهای آزمایشگاهی دستگاه محسوب می‌شوند.

در مستند رسمی محصول نیز استفاده از Running Buffer 10X with EDTA هنگام انجام DNA Sequencing و Fragment Analysis به‌طور مستقیم ذکر شده است.

تهیه Running Buffer با غلظت 1X

بافر 10X پیش از استفاده روی دستگاه باید به غلظت 1X رقیق شود.

طبق راهنمای رسمی 3130/3130xl، برای تهیه 50 میلی‌لیتر Running Buffer با غلظت 1X می‌توان:

1. مقدار 5 میلی‌لیتر 10X Genetic Analyzer Buffer را داخل استوانه مدرج ریخت
2. با آب دیونیزه حجم نهایی را به 50 میلی‌لیتر رساند.
3. محلول را به‌خوبی مخلوط کرد.

بنابراین محلول نهایی از یک نسبت 1 به 10 از بافر 10X تهیه می‌شود.

در بخش Troubleshooting راهنمای دستگاه نیز برای تهیه 30 میلی‌لیتر Running Buffer، استفاده از 3 میلی‌لیتر بافر 10X به همراه 27 میلی‌لیتر آب دیونیزه ذکر شده است.

اهمیت غلظت صحیح بافر

استفاده از Running Buffer با غلظت صحیح برای عملکرد سیستم الکتروفورز اهمیت زیادی دارد. در مستند Troubleshooting دستگاه‌های 3130/3130xl، بافر رقیق یا با کیفیت نامناسب به‌عنوان یکی از عوامل احتمالی کاهش Resolution معرفی شده و در صورت نامناسب بودن غلظت، تهیه مجدد محلول 1X توصیه شده است.

همچنین غلظت نادرست بافر می‌تواند با مشکلاتی مانند تغییر جریان الکتریکی یا اختلال در عملکرد Run مرتبط باشد؛ به همین دلیل تهیه محلول مطابق دستورالعمل سازنده اهمیت دارد.

زمان تعویض Running Buffer

در راهنمای نگهداری دستگاه‌های 3130 و 3130xl توصیه شده است Running Buffer پیش از هر Batch از Runها یا حداقل هر 24 ساعت تعویض شود. استفاده از بافر تازه به حفظ شرایط مناسب اجرای نمونه‌ها و عملکرد پایدار سیستم کمک می‌کند.

شرایط نگهداری

محلول غلیظ Running Buffer 10X with EDTA – CG باید طبق اطلاعات سازنده در دمای 2 تا 8 درجه سانتی‌گراد نگهداری شود.

پس از تهیه محلول 1X، راهنمای 3130/3130xl شرایط نگهداری زیر را ذکر می‌کند:

• در دمای 2 تا 8 درجه سانتی‌گراد: تا یک ماه
• در دمای اتاق حدود 20 تا 25 درجه سانتی‌گراد: تا یک هفته

جلوگیری از آلودگی بافر

سازنده تأکید کرده است که فرمولاسیون بافر نباید آلوده شود. ورود موادی مانند آب به محصول غلیظ، اسید، باز یا نمک‌های اضافی می‌تواند کیفیت محصول را تحت تأثیر قرار دهد. به همین دلیل رعایت اصول صحیح کار با ریجنت و استفاده از ظروف و تجهیزات آزمایشگاهی تمیز اهمیت دارد.

حجم‌های محصول Running Buffer 10X

این بافر در مستند رسمی سازنده در دو حجم معرفی شده است:

• 25 میلی‌لیتر — Cat. No. 4486293
• 500 میلی‌لیتر — Cat. No. 4486294

هر دو نسخه دارای غلظت 10X بوده و شرایط نگهداری آن‌ها 2 تا 8 درجه سانتی‌گراد ذکر شده است.

کاربردهای اصلی محصول Running Buffer 10X

این محصول برای استفاده در جریان‌های کاری مرتبط با ژنتیک آنالایزرهای 3130 و 3130xl مناسب است و مهم‌ترین کاربردهای آن شامل:

• تهیه Running Buffer برای Capillary Electrophoresis
• DNA Sequencing
• Fragment Analysis
• استفاده در فرایندهای الکتروفورز ژنتیک آنالایزر
• حفظ شرایط مناسب جداسازی قطعات DNA در سیستم‌های سری 3130

است.

10X Genetic Analyzer Buffer with EDTA یکی از مواد مصرفی مرتبط با عملکرد سیستم الکتروفورز موئینه در دستگاه‌های Applied Biosystems 3130 و 3130xl است و تهیه، رقیق‌سازی و تعویض صحیح آن بخشی از فرآیند استاندارد کار و نگهداری این دستگاه‌ها محسوب می‌شود.