دستگاه توالی یابی نسل جدید (NGS) Ion Torrent مدل S5

آشنایی کامل با دستگاه توالی یابی نسل جدید (NGS) مدل S5

دستگاه Ion Torrent S5 یکی از محبوب‌ترین سیستم‌های توالی‌یابی نسل جدید (NGS) است که با بهره‌گیری از فناوری نیمه‌رسانا (Semiconductor Sequencing) امکان اندازه‌گیری مستقیم تغییرات یونی را فراهم می‌کند؛ بدون نیاز به اپتیک پیچیده، لیزر و برچسب‌های فلورسانس. این ویژگی موجب کاهش هزینه‌ها، ساده‌سازی فرایند و افزایش سرعت تحلیل شده است.

این سیستم برای طیف وسیعی از پروژه‌های تحقیقاتی و تشخیصی طراحی شده است؛ از جمله:

• پنل‌های هدفمند ژنی (Oncology Panels, Inherited Disorders)
• توالی‌یابی DNA آزاد (cfDNA) و نمونه‌های با ورودی کم
• اگزوم، ترانسکریپتوم و ژنوم میکروبی
• NGS در میکروبیوم و ویروس‌شناسی

بررسی دقیق‌تر مشخصات و ویژگی‌های دستگاه توالی‌یابی Ion GeneStudio S5

برخی از مهم ترین ویژگی های دستگاه iontorrent s5 عبارت اند از :

• تنوع در تراشه‌ها (Chip):

این دستگاه تنوعی عالی از تراشه‌های سری 510 تا 550 دارد که با استفاده از آن‌ها می‌توان توان عملیاتی را تغییر داده و بسته به نیاز، آن را روی حدود ۲ تا 130 میلیون خوانش در هر اجرا تنظیم کرد.

• راه‌اندازی ساده:

طراحی ساده و معرف‌های کارتریجی که در دستگاه توالی یابی نسل جدید (NGS) مدل S5 طراحی شده‌اند، کمک می‌کنند تا هر فردی آن را در کوتاه‌ترین زمان ممکن راه‌اندازی کرده و بتواند به‌سادگی از آن استفاده کند. Ion AmpliSeq(برای انتخاب اهداف ژنتیکی)،  Ion Chef(برای آماده‌سازی کتابخانه الگو) و Ion Reporter (برای آنایز دقیق نتایج) فرایند توالی یابی را تبدیل به کاری سریع و بی‌دردسر کرده است.

• ارائه سریع نتایج:

این دستگاه، فرایند توالی یابی و تحلیل داده‌ها را تنها در عرض چند ساعت تکمیل کرده و نتایج را در سریع‌ترین زمان ارائه می‌کند. با استفاده از Ion Chef و فقط با ۴۵ دقیقه کار دستی، فرایند آماده‌سازی بیست‌وچهارساعته کتابخانه DNA تا دریافت داده‌ها را انجام دهید.

• فناوری خاص:

دستگاه‌های دیگر توالی یابی، برای کارکردن نیازمند برچسب‌های خاص و یا رنگ‌های فلورسانس هستند و نمی‌توانند تغییرات شیمیایی را به طور مستقیم اندازه‌گیری کنند. اما این دستگاه با استفاده از فناوری توالی یابی مبتنی بر نیمه‌هادی، تغییرات شیمیایی را به طور مستقیم اندازه‌گیری کرده و علاوه بر کاهش‌دادن هزینه‌ها، به افزایش سرعت فرایند توالی یابی نیز کمک شایانی می‌کند.

• نتایج دقیق و کامل حتی با ورودی‌های کم:

اگر بخواهید توالی یابی DNA یا RNA را با حجم کمی از نمونه انجام دهید  (مثلا از DNA آزاد استخراج شده از خون استفاده کنید)، در صورت استفاده از دیگر دستگاه‌های NGS، کار بسیار دشواری را در پیش خواهید داشت. اما با استفاده از Ion GeneStudio S5 و فناوری Ion AmpliSeq آن، تنها با استفاده از ده نانوگرم از DNA یا RNA قادر خواهید بود تا نتایج معتبر و قابل اطمینانی را به دست آورید.

• انعطاف‌پذیری و مقیاس‌پذیری بالا:

همان‌طور که اشاره کردیم، دستگاه توالی یابی نسل جدید (NGS) مدل S5 دارای تعدادی تراشه سری Ion 5 است و با استفاده از آن‌ها، گزینه‌های متنوع توان عملیاتی را برای انواع پروژه ارائه می‌کند. با خرید این دستگاه، می‌توانید یک سیستم واحد برای کاربردهای مختلف توالی یابی داشته باشید و نیازهای متغیر پروژه‌های مختلف را برطرف سازید. همچنین این دستگاه در سه مدل ارائه شده است IonGeneStudio S5، IonGeneStudio S5 Plus و IonGeneStudio S5 Prime.

• تحلیل و ذخیره‌سازی ساده داده‌ها از دستگاه توالی یابی نسل جدید (NGS) مدل S5:

تفاوتی ندارد که شما فردی مبتدی هستید یا در تحلیل و ذخیره‌کردن داده‌ها حرفه‌ای به شمار می‌روید، با استفاده از نرم‌افزارهای این دستگاه‌ها، می‌توانید اجرای فرایندها را به‌سادگی برنامه‌ریزی کرده و آن‌ها را به‌سادگی ذخیره و تحلیل کنید. یکی از این نرم‌افزارها، Suite نام دارد که از ابتدا بر روی سیستم نصب شده و در تحلیل و پیگیری اجراها نقش دارد. نرم‌افزار دیگر هم Ion Reporter نام دارد که به صورت ابری در دسترس است و به حاشیه‌نویسی و تفسیر متغیرها کمک می‌کند.

• پشتیبانی همیشگی و جامع :

شرکت آرینا حیات دانش متخصصین مجرب زیادی دارد که شما می‌توانید در هر زمان و مکانی، پشتیبانی لازم را از آن‌ها دریافت کنید. این پشتیبانی، خدمات نصب و راه‌اندازی، بررسی عملکرد درست دستگاه، برنامه‌های پشتیبانی و دوره‌های تخصصی آموزشی را در بر می‌گیرد. پشتیبانی‌های لازم برای ذخیره‌سازی امن و پشتیبان‌گیری از داده‌های دستگاه توالی یابی نسل جدید (NGS) نیز توسط کارشناسان ارائه می‌شود.

در واقع می توان گفت با خرید Ion Torrent S5 از آرینا حیات دانش ، آزمایشگاه‌ ژنتیک مولکولی شما به یک پلتفرم:

✔ اقتصادی
✔ سریع
✔ مقیاس‌پذیر
✔ مناسب تحقیقات و تشخیص

دسترسی پیدا می‌کنند که متناسب با نیاز آینده قابل ارتقاء است.