کیت NGS مدل ClinEX pro برند 4bases

پوشش ژنتیکی گسترده کیت ClinEX pro

یکی از بهترین و برجسته‌ترین ویژگی‌های این کیت، پوشش ژنتیکی بسیار گسترده آن است. کیت ClinEX پرو بیش از ده‌هزار ژن موجود و مرتبط با پاتولوژی‌های شناخته‌شده در پایگاه‌داده OMIM را پوشش می‌دهد. علاوه بر این، می‌تواند حدود ۱۳۰ ناحیه hotspot، Single Nucleotide Variants و نواحی عمیق درون رونده یا deep intronic regions را نیز پوشش دهد. این موارد، با بیماری‌های ارثی شناخته شده همبستگی قوی دارند. پوشش ژن‌های میتوکندریایی نیز به طور انتخابی در این محصول وجود دارد و می‌تواند در تحلیل‌ها قرار بگیرد.

اندازه کل ناحیه هدف یا همان total target size در کیت ClinEX pro، در حدود ۱۹.۵ تا ۲۱ مگابایت است. این پوشش جامع، به محققان کمک می‌کند تا طیف وسیعی از واریانت‌های ژنتیکی مؤثر در بروز بیماری‌ها را شناسایی کنند.

گردش کار (Workflow) کیت

این کیت، مبتنی بر روش capture-based است و دقت بالایی در شناسایی انواع واریانت‌های ژنتیکی دارد. یکی دیگر از مزیت‌های کلیدی این کیت، کوتاه‌بودن زمان انجام پروتکل است. کل پروتکل کپچر این کیت در کمتر از ۳۶ ساعت تکمیل می‌شود و hands-on-time (زمان درگیر بودن کاربر با نمونه‌ها و تجهیزات)، تنها کمتر از سه ساعت است. به‌طورکلی، دریافت نمونه DNA تا ارائه داده‌های نهایی در این کیت کمتر از دو و نیم روز به طور می‌انجامد و گزارش‌دهی بالینی را تسریع می‌کند.

این کیت تمامی معرف‌های لازم برای هدف‌گذاری بیش از ۱۰,۰۰۰ ژن و آماده‌سازی کتابخانه برای توالی یابی NGS را دارد. این کیت با پلتفرم‌های توالی یابی Oxford Nanopore Technologies، Ion Torrent، MGI، Element Biosciences، Illumina و Thermofisher sequencers سازگار است. تجزیه‌وتحلیل داده‌ها نیز تنها با پلتفرم اختصاصی خود کمپانی یعنی 4eVAR انجام می‌شود. این پلتفرم اختصاصی، دقت نتایج را افزایش داده و کنترل کاملی هم بر کل فرایند دارد. برای تفسیر واریانت هر نمونه، یک گزارش کامل شامل SNVها و CNVها با طبقه بندی American College of Medical Genetics and Genomics ارائه می‌شود.

در کل فایل‌های خروجی این پلتفرم، برای تجزیه‌وتحلیل ایده‌آل هستند و متریک‌های کیفی، هم‌ترازی، وضعیت CNVها، جدول کامل واریانت‌ها، ژنوتیپ و تجزیه‌وتحلیل میتوکندری را در برمی‌گیرند. تمامی این گزارش‌ها، قابلیت شخصی‌سازی هم دارند.

اصلی‌ترین مشخصات کیت

این کیت در آزمایشگاه‌های بالینی اعتبارسنجی شده و کل پروتکل آن بر روی استانداردهای DNA و نمونه‌های بالینی آزمایش شده تا اطمینان از قابلیت‌های آن به اثبات برسد. کیت ClinEX pro قابلیت بررسی و تحلیل نمونه‌های استخراج شده از بافت‌های زنده یا منجمد، خون و مایعات را دارد. میزان DNA ورودی برای هر ناحیه نیز باید حداقل ۵۰ نانوگرم باشد. واریانت‌های قابل‌شناسایی این کیت، SNVها (SNPs)، ایندل‌ها (indels) و CNVها هستند و نسخه اتوماسیون نیز برای این کیت موجود است.

این کیت در قالب‌های مختلف و برای تعداد آزمایش‌های متفاوت موجود است. به طور مثال، کیت سری C3030-16 برای ۱۶ تست و کیت سری C3030-96 برای ۹۶ تست بهینه‌سازی‌شده است. حجم معرف‌های موجود در هر کیت به‌گونه‌ای محاسبه شده که امکان تقسیم‌بندی به چندین جلسه تجزیه‌وتحلیل هشت نمونه‌ای وجود داشته باشد. تقسیم‌بندی کیت به روش‌های متفاوت، تعداد کل آزمایش‌ها را کاهش خواهد داد.

تعداد نمونه‌های قابل مالتی‌پلکس‌کردن کیت به عوامل زیادی مثل تخریب gDNA اولیه، میزان آلاینده‌های موجود و روش بارگذاری کتابخانه بستگی دارد. تعداد پیشنهادی نمونه‌ها در هر تراشه بر اساس پنج درصد تکرار و هشتاد و پنج درصد on-target بودن تخمین زده شده است. اما تعداد دقیق و بهینه نمونه باید به صورت تجربی و بر اساس عوامل محیطی و خروجی موردانتظار محاسبه شود. برای کسب اطلاعات بیشتر در خصوص این کیت می‌توانید با کارشناسان آرینا حیات دانش تماس بگیرید.

قیمت و خرید کیت ClinEX pro

بهترین راه برای اطمینان کافی از اصالت این محصول، خرید آن از واردکننده اصلی و مستقیم آن است. آرینا حیات دانش تنها واردکننده اصلی این کیت به ایران است و تمامی شرکت‌های دیگر، این کیت و سایر محصولات برند 4bases را از این شرکت خریداری می‌کنند.

یکی از مزیت‌های بزرگ این شرکت، علاوه بر فروش محصولات با ضمانت اصالت و قیمت مناسب، خدمات پس از فروش فوق‌العاده قوی است. شما می‌توانید پس از خرید کیت ClinEX pro از خدمات نصب، کالیبراسیون و آموزش استفاده در محل بهره‌مند شوید. حتی می‌توانید در ایونت‌های آموزشی رایگان کار با کیت شرکت کرده و بهترین روش‌های استفاده را یاد بگیرید.

جدول مشخصات و ویژگی‌های محصول