کیت NGS مدل BRaCA screen برند 4bases

آشنایی با کیت BRaCA Panel برند 4bases و ویژگی های آن

4bases BRaCA Panel یک پنل مولکولی مبتنی بر Amplicon Sequencing است که برای بررسی ژن‌های مرتبط با سرطان‌های وابسته به BRCA توسعه یافته است. این کیت امکان بررسی تغییرات ژنتیکی در دو ژن مهم BRCA1 و BRCA2 را با استفاده از تکنولوژی Next Generation Sequencing یا NGS فراهم می‌کند. طبق اطلاعات رسمی سازنده، BRaCA Panel برای شناسایی انواع مختلف واریانت‌های ژنتیکی از جمله SNVs، Indels و CNVs طراحی شده است.

4bases این محصول را در مجموعه پنل‌های انکولوژی خود ارائه کرده و در فلایر رسمی از آن برای Hereditary and Somatic Profiling در سرطان‌های مرتبط با BRCA یاد می‌کند. در توضیحات همان فلایر، به‌طور مشخص بر شناسایی واریانت‌های Germline در BRCA1 و BRCA2 نیز تأکید شده است.

پوشش ژن‌های BRCA1 و BRCA2

BRaCA Panel نواحی کدکننده ژن‌های BRCA1 و BRCA2 را به همراه 25 جفت‌باز مجاور در انتهای 3′ و 5′ پوشش می‌دهد. اندازه پنل حدود 30 kb است و برای هر نمونه حداقل 10 ng DNA به‌عنوان ورودی موردنیاز اعلام شده است. در مشخصات رسمی محصول، DNA استخراج‌شده از بافت‌های بدن، از جمله خون، به‌عنوان نوع نمونه قابل استفاده ذکر شده است.

در صفحه نخست فلایر نیز سازنده به اعتبارسنجی کیت برای آنالیز DNA استخراج‌شده از نمونه‌های خون اشاره کرده است.

شناسایی SNV، Indel و CNV

یکی از ویژگی‌های مهم BRaCA Panel امکان بررسی چند گروه از تغییرات ژنتیکی در یک Workflow مبتنی بر NGS است. طبق مشخصات سازنده، انواع Variant قابل بررسی توسط این پنل عبارت‌اند از:

• SNV / SNP
• Indel
• CNV

این قابلیت امکان بررسی جامع‌تر تغییرات مرتبط با BRCA1 و BRCA2 را در مقایسه با روش‌هایی که صرفاً یک نوع Variant را ارزیابی می‌کنند، فراهم می‌سازد.

پروتکل سریع و کاهش Hands-on Time

Workflow پنل BRaCA به‌گونه‌ای طراحی شده که مراحل آماده‌سازی کتابخانه و توالی‌یابی با زمان کار عملیاتی محدود انجام شود. بر اساس اطلاعات 4bases، فرایند از DNA تا مرحله Sequencing در کمتر از 1.5 روز قابل انجام است و مجموع Hands-on Time کمتر از 2 ساعت اعلام شده است.

Workflow نمایش‌داده‌شده در صفحه اول فلایر شامل مراحل gDNA، Enrichment PCR، Indexing PCR، تهیه Final Library، Sequencing و در نهایت تحلیل داده است. سازنده همچنین وجود نقاط توقف متعدد در پروتکل را برای انعطاف بیشتر در برنامه کاری اپراتور ذکر کرده است.

سازگاری با پلتفرم‌های مختلف NGS

یکی از مزایای BRaCA Panel انعطاف در انتخاب پلتفرم توالی‌یابی است. پروتکل این محصول برای استفاده با چندین سیستم NGS در نظر گرفته شده است، از جمله:

Illumina، Oxford Nanopore Technologies، Ion Torrent، MGI، Element Biosciences و GeneMind.

با این حال نوع Regulatory Kit بسته به پلتفرم متفاوت است. طبق جدول مشخصات رسمی، گزینه‌های CE-IVD برای Illumina و Oxford Nanopore Technologies ذکر شده‌اند، در حالی که گزینه‌های مربوط به Ion Torrent، MGI، Element Biosciences و GeneMind به‌صورت RUO معرفی شده‌اند.

تحلیل داده با پلتفرم 4eVAR

برای تحلیل داده‌های حاصل از پنل BRaCA می‌توان از پلتفرم اختصاصی 4eVAR شرکت 4bases استفاده کرد. این راهکار برای پردازش و گزارش داده‌های حاصل از آنالیز طراحی شده و طبق اطلاعات سازنده خروجی‌هایی شامل Quality Metrics، Alignment، وضعیت CNVها، Full Variant Table، Genotype، Coverage و گزارش قابل شخصی‌سازی ارائه می‌کند.

4bases همچنین بر تحلیل امن داده‌ها توسط راهکار اختصاصی خود و امکان پشتیبانی تخصصی در جریان تحلیل تأکید کرده است.

نسخه‌ها و کدهای محصول

BRaCA Panel در دو نسخه اصلی در مستند رسمی معرفی شده است:

BRaCA Panel CE-IVD — کد H1070

در ظرفیت‌های 16 و 96 تست

BRaCA Panel RUO — کد RH1070

در ظرفیت‌های 16 و 96 تست

بنابراین هنگام سفارش یا استعلام محصول، نوع پلتفرم توالی‌یابی، نسخه موردنیاز و تعداد تست‌ها باید مشخص شود.

ویژگی‌های فنی کیت BRaCA Panel

قیمت و خرید کیت BRaCA Panel

آرینا حیات دانش تنها واردکننده اصلی این کیت به ایران است و تمامی شرکت‌های دیگر، این کیت و سایر محصولات برند 4bases را از این شرکت خریداری می‌کنند.

یکی از مزیت‌های بزرگ این شرکت، علاوه بر فروش محصولات با ضمانت اصالت و قیمت مناسب، خدمات پس از فروش فوق‌العاده قوی است. شما می‌توانید پس از خرید کیت BRaCA از خدمات نصب، کالیبراسیون و آموزش استفاده در محل بهره‌مند شوید. حتی می‌توانید در ایونت‌های آموزشی رایگان کار با کیت شرکت کرده و بهترین روش‌های استفاده را یاد بگیرید.